قصة الأنمي / حرب الكأس المقدسة هي معركة عنيفة بين السحرة حيث يتقاتل فيها سبعة أسياد وخدمهم المستدعون من أجل الكأس المقدسة ، وهي قطعة أثرية سحرية يمكنها منح المنتصر أي أمنية. منذ ما يقرب من 10 سنوات ، أحدثت المعركة النهائية لحرب الكأس المقدسة الرابعة دمارًا في مدينة فويوكي و خلّفت أكثر من 500 قتيل ، تاركة المدينة مدمرة. إيميا شيرو ، أحد الناجين من هذه المأساة ، يطمح لأن يصبح بطلاً للعدالة مثل منقذه والده بالتبني ، إيميا كيريتسوغو. على الرغم من كونه طالباً ، إلا أنه تم إلقاء "شيرو" في حرب الكأس المقدسة الخامسة عندما رأى عن غير قصد معركة بين الخدم في المدرسة و استدعى خادمته الخاصة ، سيبر. عندها يبدأ ظل غامض بالإنغماس بالقتل في مدينة فويوكي، يصطف شيرو مع توساكا رين ، و هي زميلة مشاركة في حرب الكأس المقدسة ، من أجل إيقاف موت عدد لا يحصى من الناس. ومع ذلك ، فإن مشاعر شيرو لصديقته المقربة ماتو ساكورا تؤدي به إلى التعمق أكثر في الأسرار المظلمة المحيطة بالحرب و العشائر المتعادية المتورطة.